SAILOR MOON R   Un noche se estrello en medio de la ciudad de Tokio un meteorito, en él viajaban Ann y Alan, dos aliens que habían llegado a la tierra para hacerse con la energía humana haciéndose pasar por dos estudiantes en la escuela de Usagi con los nombres de Natsumi y Seijuro, todo el mundo fue a ver que había sido lo que causara el cráter, allí se encontraron Usagi, Amy y Makoto, allí también estaban Ray y Minako, casualmente Usagi se encontró con Mamoru en ese mismo lugar, ocasión en la que volvieron a discutir una vez más.  Con el paso del tiempo Luna se ve obligada tras los ataques a personas inocentes por el afán de energía de los aliens, a devolverle los recuerdos a Usagi y más tarde a las demás guerreras, en cuanto Usagi recuperó sus recuerdos, de lo que en un principio no se sentía muy contenta tan solo le alegraba el hecho de poder estar junto a su querido Mamoru. Al día siguiente se lo encontró por la calle ella se agarró a él por lo que se extrañó pues el no había recuperado sus recuerdos, cuando Usagi se dio cuenta apareció Natsumi que en otra ocasión ya se lo había encontrado por lo que ella pretendía su amor al igual que Usagi.  Usagi cada día estaba más preocupada pues no había ningún síntoma de que Mamoru hubiera recuperado la memoria. Al mismo tiempo en cada batalla aparece el Caballero de la luna, para salvar a la Sailor Moon, en un principio ella cree que es el mismo Mamoru, pero en una ocasión al verlos juntos se da cuenta de que no por lo que se queda muy triste y desconsolada.  Cada vez que se le presenta una oportunidad para estar con Mamoru la aprovecha, una tarde cuando volvía d de la escuela vio que un cardian atacaba a unos bebes, casualmente pasaba por allí Mamoru, acompañaron a los bebes y a sus madres en la ambulancia, al llegar al hospital vieron que uno de los bebes no había resultado herido por lo que al no poder cuidarlo su madre Mamoru se ofreció voluntario para cuidarlo y Usagi de pasó también se apuntó, cuando Natsumi se enteró decidió ayudar a Mamoru por lo que Usagi se enfadó al final todo se solucionó reforzando así Usagi su amistad con Mamoru.  Un día Usagi se encontró con Mamoru, él se dirigía hacia la casa de Natsumi, pues ella decía estar enferma por lo que faltaba a clase, Usagi trataba de impedírselo pues sospechaba que ella fuera Ann, por lo que Mamoru estaba en peligro, como no pudo detenerlo lo acompañó, al llegar Seijuro los invitó a tomar un pastel por lo que ella decidió quedarse, mientras Seijuro distraía a Mamoru, Natsumi trataba de engañar a Usagi para que entrara donde se encontraba el árbol , ella intentó resistirse pero Natsumi la empujó, el árbol la agarró y empezó a quitarle su energía, las Sailors enteradas del peligro que corría Usagi fueron hacía allí, cuando llegaron el árbol les había quitado la energía a Usagi y a Mamoru,  Ann y Alan lograron derrotar a las Sailors y al Caballero de la luna que había aparecido, por lo que Usagi tubo que transformarse, Ann y Alan quedaron sorprendidos, Sailor Moon corrió para atender al inconsciente Mamoru, cuando despertó el le cogió la mano y Sailor Moon intentó que recuperara la memoria, por lo que Ann se sintió traicionada y empezó a atacarlos Sailor Moon interpuso su cuerpo con el de Mamoru para la sorpresa de los aliens y de él mismo, ella seguía atacándoles por lo que Mamoru empezó a proteger a Sailor Moon, Alan empezó a comprender el verdadero significado del  amor, cuando el árbol iba a atacar a Alan, Ann se interpuso y le dio a ella, al fin comprendieron el verdadero significado del amor, por lo que el árbol les contó de donde provenían, Sailor Moon lo purificó y desapareció, de repente ante ella apreció el Caballero de la luna que había desaparecido, le reveló su identidad, para la sorpresa de Sailor Moon vio que era igual a Mamoru, él le contó que era un doble de él, al luchar contra el Negaverso, había perdido la memoria, pero el deseo de proteger a la persona que más amaba creó al Caballero de la Luna, ahora deberían fusionarse en un solo cuerpo, al hacer esto Usagi abrió los ojos y estaba al lado de Mamoru, él por fin había recuperado la memoria y por fin podrían estar juntos, así Ann y Alan emprenden un nuevo viaje.  Un día estaban Usagi y Mamoru en un romántico paseo en vote hablando sobre su futuro juntos, los dos eran muy felices, cuando se dirigían al muelle al salir, él la cogió de la mano para salir, cuando ella tropieza y se apoya en él, se cruzan la mirada y se dan un romántico beso, de repente una pelo cae del cielo y le da a Mamoru en la cabeza, en el cielo aparece una nube rosa que se abre y de ella cae una niña sobre la cabeza de Usagi quedando encima de Mamoru, esta niña dice llamarse igual que Usagi y lleva el mismo peinado, por lo que ella se enfada, al llegar a su casa esa niña está allí y dice ser  su prima, Usagi se tranquiliza al pensar que Mamoru le había dicho que el estaría a su lado, ese mismo día aparece un nuevo enemigo, que al parecer busca a esa niña para matarla.  (Imagen de Chibi Usa)  Al día siguiente Usagi sale de su casa en busca de Chibi Usa, así la llamaban ahora, cuando se encuentra con Mamoru, el dice que los ha unido el destino cuando se van a besar, cuando aparece Luna y le recuerda lo que ha pasado, los dos salen juntos a buscarla cuando la encuentran Mamoru se muestra muy amable con ella por lo que Usagi se pone celosa, al llegar a su casa su padre se alarma por Mamoru y se pone muy triste pues dice que ya tiene novio, ante esa situación Mamoru avergonzado sale corriendo; Más tarde Mamoru va por la calle cuando ve una imagen en la que una voz le dice que si esta junto a Usagi algo terrible le pasaría a ella por lo que tendría que dejarla, de repente aparece Usagi y muy alegre se le abraza  diciendo que otra vez los ha unido el destino él la aparta y le dice que la deje en paz y que ya no quiere volver a verla, Usagi se queda muy asombrada cuando Mamoru se va ella va a ver a sus amigas que le aconsejan que debería ir a su casa a pedirle disculpas pues debía estar enfadado con ella por algo, ella se decide a ir, al abrirle la puerta ella le pide disculpas por si le había ofendido el le responde que hablaba en serio y que no quiere volver a verla, Usagi se da cuenta de que Chibi Usa estaba allí por lo que le pregunta si ahora la quiere más a ella, el le dice que no sea tonta y se va con las lagrimas en los ojos a punto de llorar, sale corriendo y entra en una cabina telefónica para llorar, al salir entra en una tienda donde casualmente estaba el enemigo, al hablar el droido despectivamente del hombre que le ha roto el corazón ella se enfada y el droido la ataca por lo que se transforma, cuando  estaba apunto de ser atacada aparece Tuxedo Mask para salvarla, al terminar con él, Tuxedo Mask se va pero Sailor Moon alcanza a preguntarle porque la ha salvado si dice que ya no la quiere, el evade la pregunta y le dice que no le gustan las chicas débiles por lo que ella se propone ser más fuerte a partir de ese momento.  En la sucesión del tiempo Mamoru estaba cada vez más con  Chibi Usa, por lo que Usagi estaba cada vez más celosa, aunque tenía en cuenta lo que estaba sufriendo por su madre. En medio de una batalla el droido atacó a Sailor Moon sumiéndola en un profundo sueño en el que veía como Mamoru estaba cada vez más lejos y ella no lo podía alcanzar, esa misma mañana había visto a Mamoru con una chica por lo que ella supuso que sería su novia, deprimida empezó a comer pues ya no le importaba nada, el droido estaba dejándola sin energía, Luna recordó lo que Usagi le había dicho por lo que fue corriendo en busca de Mamoru, el no quiso ir pero Luna lo convenció, al llegar allí vio que casi no le quedaba energía, al besarla toda la energía volvió a su cuerpo terminando así con el droido y en el sueño conseguía alcanzar a Mamoru, al levantarse, ella dio por supuesto que la quería pero el se fue negando que algo hubiera cambiado entre ellos, quedando ella en el suelo junto a una rosa que se le había caído y el  derramando una lágrima por lo que había tenido que decirle.    En  una ocasión en la que el enemigo utilizaba como cebo unas pulseras para cumplir deseos, Usagi hacia la suya con mucho empeño para que le cumpliera el deseo de volver a conseguir el amor de Mamoru, mientras hacía la suya se quedó dormida y tubo el mismo sueño que Mamoru, por lo que decidió ir a hablar con el, al llegar a su casa él no le dejó pasar, entre llantos al intentar entrar le preguntó si había tenido algún sueño extraño por lo que él le dejó pasar cuando ella se lo contó él le dijo que tendrían que estar separados para que no le pasara nada ni a ella ni a la tierra, como Usagi no estaba de acuerdo con que hiciera falta que estuvieran separados lo intentó convencer diciéndole que si hiciera falta ella moriría pero él la echó de su casa, al salir de allí apareció el droido, al vencerlo gracias al apoyo de sus amigas fue tras él  para decirle: “No me importa lo que nos pueda pasar, solo tenemos que gozar de este momento” tras esto Usagi se le abrazó y se dieron un beso con el que reconciliaron definitivamente. Cuando Esmeralda termina de abrir la puerta, todos viajan al futuro para ayudar a la madre de Chibi Usa, al llegar se encuentran con Sailor Plutón, Al llegar al Tokio de Cristal ven que todo está devastado y no hay nadie, Chibi Usa sale corriendo y desaparece, de entre la niebla aparece un hombre parecido a Tuxedo Mask, él les dice que es el Rey Endimión el  Tuxedo Mask del futuro, los lleva al castillo allí les cuenta lo que le ha pasado a la tierra, también les enseña la urna de cristal donde está la Neo Reina Serénity, y que esa será Usagi en el futuro y que el sueño que les había hecho separarse se lo había producido él, pues con un amor infantil no sería capaz de destruir al enemigo solo con un amor incorruptible, tras esto les enseña a la hija del Rey Endimión y de la Neo Reina Serénity que resulta ser Chibi Usa, de lo que todos se quedan muy sorprendidos. Tras todas estas sorpresas irrumpe Diamante, que ya se había fijado en Usagi por su parecido con la Neo Reina, y se lleva a Sailor Moon ante los ojos impotentes de los demás a los que había paralizado.  Usagi despierta en una habitación y ve que lleva un vestido parecido al de la Neo Reina y que su broche está a su lado, intenta transformarse pero no es capaz, Diamante entra en la habitación y a la fuerza intenta besarla, Usagi está paralizada y se le saltan las lagrimas pensando que solo quiere que la base Mamoru y no ningún otro hombre, de repente aparece Tuxedo Mask, que se la lleva, se van lejos de donde estaba Diamante, prometen que estarán siempre juntos y se besan, en el palacio de cristal estaban todas preocupadas hasta que los vieron volver, allí con el cristal plateado intentaron despertar a la Neo Reina Serénity, pero no lo consiguieron por lo que Chibi Usa se escapó y fue capturada, sin que los demás se enteraran, por el gran Sabio, cuando ella recordó que ansiando convertirse en una dama como su madre cogiera el cristal plateado, para convertirla en Black Lady. Cuando se dieron cuenta de que Chibi Usa había vuelto al presente todos volvieron ellos también, allí s encontraron con Black Lady y pronto se dieron cuenta de que se trataba de Chibi Usa, cuando se abrió del todo el portal el Gran Sabio habiendo terminado ya con Diamante y Zafiro, le mandó a Black lady la energía del cristal oscuro, Usagi se transformó en la Neo Reina Serénity e hizo que Chibi Usa volviera a su estado normal, con la ayuda de los dos cristales plateados, el del presente, y el del futuro acabaron con  el fantasma de la muerte que era la verdadera identidad del Gran Sabio. Cuando todo acabó y vencieron al enemigo Chibi Usa tubo que despedirse por que debía volver al futuro, y así termina esta segunda temporada con Usagi y Mamoru mirándose el uno al otro mientras Chibi Usa volvía con sus padres, el rey Endimión y la Neo Reina Serénity que por fin estaban juntos.